在神佛習合的時代，乘鞍嶽是整座山本身就是神。乘鞍大權現。權現，指的是佛和菩薩暫時化為日本的神而顯現。在明治神佛分離之前，人們把整座山當作神體來仰望。
山頂神社的起源，有兩種傳說。養和元年，1181年，木曾義仲的家臣為了偵察飛驒國的情況攀上山頂，安放了一尊黃金神像，祈禱戰爭勝利。另一種說法是，大同二年，807年，坂上田村麻呂登山祈願。這兩種說法，都確認不到可靠的記錄。
到了江戶時代，相傳圓空登上了這座山，在朝日權現社正下方的小巖窟裡閉關祈禱。
明治的神佛分離，讓山嶽信仰的樣子發生了很大變化。山本身就是神體的時代結束了，山開始以神社之名受到供奉。
大日嶽被視為眾神所坐的磐座，作為乘鞍本宮的奧之院，至今仍禁止進入。
疊平有一處遙拜所，叫中之宮，建於1953年，為祈願登山者和遊客的安全。不必登上山頂，也能向四位神明合掌。
供奉這座山的人的腳步，通向山頂，也通向路途中那些小小的神社，至今沒有停下。
